Leta 2007 je odvetniška družba Covingtoh & Burling LLP, ki zastopa interese sedmih španskih vlagateljev - delničarjev Yukosa, na Stockholmskem mednarodnem arbitražnem sodišču vložila tožbo proti Rusiji. Tožniki so od ruske vlade zahtevali odškodnino, pri čemer so se sklicevali na dejstvo, da so zaradi dejanj državnih in sodnih organov Ruske federacije utrpeli finančne izgube. V skladu z rusko-španskim dogovorom o medsebojni zaščiti naložb se izgube, ki jih imajo vlagatelji zaradi nezakonitih dejanj države, povrnejo.
Bistvo tožbe je bilo v tem, da je ruska stran namerno bankrotirala YUKOS, kar je povzročilo finančno škodo delničarjem podjetja. Pooblaščene osebe iz Rusije, ki so se v Stockholmski arbitraži pojavile kot obdolženka, zahtevka niso priznale, ker se je po njihovem mnenju vodstvo Yukosa dolgo časa izogibalo plačevanju davkov v posebej velikem obsegu in kršilo druge zakone Ruske federacije. Prav to je povzročilo kazenske primere nad upravo YUKOS-a, pa tudi njegov bankrot.
Vendar se je arbitražno sodišče v Stockholmu postavilo na stran tožnikov in razsodilo, da jim mora Rusija za nastalo škodo plačati 2,7 milijona dolarjev. Znesek izgub je bil izračunan na podlagi višine kapitalizacije YUKOS-a v času njegovega stečaja. V odločitvi arbitražnega sodišča je bilo poudarjeno, da so davčne terjatve le pretveza za zaseg premoženja Yukosa, dejanski namen kazenskega pregona vodstva podjetja pa je bila želja, da se davki ne bi zakonito pobirali, ampak bi se podjetje razlastilo. To pomeni, da je sodišče prišlo do zaključka, da je ruska stran namerno bankrotirala YUKOS, da bi večji del premoženja prejela državni družbi Rosneft in Gazprom. Poudariti je treba, da je to že druga odločitev arbitražnega sodišča v Stockholmu, ki na podlagi zahtevkov delničarjev Yukosa Rusiji ni bilo naklonjeno.
Zakaj Rusija izgublja tovrstne zahtevke na mednarodnem arbitražnem sodišču? Seveda se lahko sklicujemo na množično propagandno kampanjo, zaradi katere se je nekdanji šef Jukosa M. Hodorkovski v očeh zahodnega javnega mnenja pojavil kot opozicionar, ki je trpel zaradi svojih političnih in demokratičnih prepričanj. Omenimo lahko zelo neprijazen odnos švedskih vladajočih krogov do Rusije. Kljub temu ostaja dejstvo: na Zahodu menijo, da so ruske oblasti v aferi Yukos kršile lastninsko pravico. In sam koncept "lastnine" je tam svet.
Podobno odločitev je sprejelo tudi strasbourško sodišče za človekove pravice, ki je, čeprav je priznalo, da preganjanje Yukosa in njegovega vodstva ni bilo politično motivirano, kljub temu opozorilo na kršitev lastninske pravice pri prerazporeditvi premoženja podjetja.